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DIA定量蛋白質(zhì)組


產(chǎn)品簡介

DIA技術(shù)主要采用數(shù)據(jù)非依賴性采集模式(Data-Independent Acquisition,DIA),通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)將整個質(zhì)譜掃描質(zhì)量范圍分為若干個窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,采集全部子離子信息。

研究方法


DIA流程圖


技術(shù)優(yōu)勢

全景式掃描,采集所有離子及碎片譜圖,數(shù)據(jù)無遺漏;

鑒定敏感度高,可以鑒定更多低豐度蛋白;

蛋白質(zhì)覆蓋率、定量準確性高;

DIA缺失值更少,結(jié)果可重復性高,數(shù)據(jù)可回溯。

案例解析

家族性帕金森病患者尿蛋白質(zhì)組分析[1]

研究背景

帕金森?。?/span>PD)的患病率正在上升,但是新的治療策略和治療方法的發(fā)展改變了疾病的進程,這將得益于特異、敏感和無創(chuàng)的生物標志物來早期檢測PD。

研究目的

通過尿液蛋白組學進行突變攜帶者的突變狀態(tài)和疾病表現(xiàn)進行分類,以及尋找帕金森發(fā)生發(fā)展生物標志物。

研究結(jié)果

基于DIA蛋白組學技術(shù)對家族性帕金森?。?/span>PD)患者的尿液進行測序分析尋找,揭示了具有LRRK2 G2019S突變的個體中溶酶體失調(diào),結(jié)合機器學習,發(fā)現(xiàn)尿蛋白組學對于PD患者的生物標志物發(fā)現(xiàn)和患者分層具有重要研究價值。


基于質(zhì)譜的兩個獨立尿液PD隊列的蛋白質(zhì)組學分析流程


參考文獻

[1] Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinson's disease[J]. EMBO Molecular Medicine, 2021.

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